1957 年 7 月，美籍宣教士 戴德森 醫師夫婦（ Dr. Marcy Ditmanson and Mrs. JoyceStranks Ditmanson ）應「美國信義會海外宣道部」之差派，前來台灣策劃醫療佈道事工。

1958 年 6 月， 戴德森 醫師夫婦從花蓮遷居嘉義。

1958 年 8 月，在自宅開始診療工作，並購德製小型巴士在鄉村及阿里山山地巡迴醫療。

1961 年 3 月，於現今台斗坑興建門房及倉庫，命名為「嘉義信義會診所」。

1962 年 4 月，興建完成三十張病床之醫院，更名為「嘉義基督教醫院」。

1967 年 9 月，「小兒麻痺中心」成立，共有病床 100 床。

1975 年 外科醫療大樓落成，共有 135 床，並結束國外援助經費，成為國人自給自足之醫院。

1985 年 10 月，綜合大樓落成，共有病床 218 床。

1988 年 4 月，獲得衛生署及教育部評鑑為「地區教學醫院」。

1991 年 5 月，通過區域教學醫院之評鑑，成為嘉雲地區第一所區域教學醫院。

1991 年 10 月，動工興建「戴德森紀念大樓」，病床規模達到 410 床。

1994 年 5 月，第二次通過衛生署區域教學醫院評鑑。

1994 年 5 月，成立雲嘉第一個「生殖科技研究室」。

1995 年 9 月，成立雲嘉地區第一座「心臟血管中心」。

1996 年 1 月，成立宣教部，專責推廣國內外醫療宣教事工。

1996 年 2 月， 戴德森 醫師榮獲「中華民國第六屆醫療奉獻獎」。

1997 年 5 月，第三次通過衛生署區域教學醫院評鑑，規模雲嘉最大。

1998 年 前院長翁瑞亨獲頒行政院衛生獎章。

1998 年 開始著手逐步建構「癌症治療中心」各相關專科。

1998 年 12 月，「醫學影像中心」成立，雲嘉第一台直線加速器開始啟用，並設置 Mini-PACS 。

1999 年 5 月， A 棟住院大樓完工，全院床數增加至 800 床。

1999 年 7 月，「第一門診中心」正式啟用。

1999 年 8 月，雲嘉首例腎臟移植成功。

1999 年 9 月，成立護理之家。

1999 年 10 月，雲嘉地區首例骨髓移植成功，並於 12 月完成第二例。

1999 年 12 月，獲行政院內政部補助計畫，開始推展嘉義縣市獨居老人居家服務工作。

2000 年 陸續成立「皮膚醫學美容中心」、「燒傷中心」、「高壓氧治療中心」、「整形醫學美容中心」、「核子醫學科」。

2000 年 3 月，受嘉義縣市政府委託辦理「發展遲緩兒早期療育中心」。

2000 年 5 月，通過衛生署區域教學醫院乙類評鑑，為雲嘉規模最大之教學醫院。

2000 年 6 月，前院長翁瑞亨卸任，由現任院長陳誠仁擔任院長一職。翁瑞亨院長並於2001 年 3 月轉任為行政院衛生署保健處處長， 2001 年 7 月擔任首任衛生署國民健康局局長。

2000 年 6 月，創院院長 戴德森 醫師在美國逝世，享年 81 歲。

2001 年，戴德森文教基金會榮獲原住民部落及離島社區健康營造評比冠軍。

2001 年 獲行政院衛生署國民健康局補助成立「南區癌症防治中心」、「南區青少年保健中心」、「南區視力保健中心」。

2001 年 10 月，新醫療大樓落成，全院總床數達 1000 床，員工近 2000 人。

2001 年 12 月，獲行政院原住民委員會頒發「促進原住民發展有功非原住民團體獎」。

2001 年，榮獲第一屆「部落健康營造評比」全省第一名。

2002 年，獲行政院衛生署舉辦「原住民部落及離島地區社區健康營造」評選「優等」。

2002 年，獲行政院衛生署「山地離島及原住民地區護理人員貢獻獎」。

2002 年 3 月，成立星愛兒童發展中心，開辦嘉雲地區第一個也是唯一的「自閉症兒童日間病房」 。

2002 年 4 月，成立全台第一個「照顧住宅」。

2002 年 10 月， 榮獲法務部頒發「推展犯罪被害人保護工作有功團體獎」。

2002 年 11 月， 主辦「第九屆台日韓教會醫院高階主管會議」，就「教會醫院與社區醫療服務工作及外展工作的現況與展望」進行分享與討論。

2002 年 12 月，完成雲嘉首例活體腎臟移植。

2003 年 響應衛生署推動「 家庭 醫師整合性照顧計劃」，結合基層診所醫師，提供社區民眾就醫、轉診，轉檢所需的持續性醫療照護。

2003 年 1 月，嘉基志工隊獲選全國績優團隊。

2003 年 3-6 月， SARS （嚴重急性呼吸症候群）期間，本院全體員工齊心對抗疫情，並獲衛生署肯定。

2003 年 4 月，與國立嘉義大學合作推動醫療專業課程。

2003 年 5 月，通過衛生署區域教學醫院乙類評鑑，為雲嘉規模最大之教學醫院。

2003 年 6 月，嘉義縣居家服務中心開辦老人日間照顧。

2003 年 7 月，與地區醫療診所連線 家庭 醫師整合性照護制度上路。

2003 年 12 月，早期療育中心成立嘉義地區山線服務處。

2003 年 12 月，承接嘉義市政府委託開辦嘉義市身心障礙綜合園區 -- 再耕園開幕。

2004 年 1 月，接受衛生署疾病管制局委託，成 為嘉義地區傳染病專責醫院之支援醫院。

2004 年 2 月，建構 PACS 系統，全院無片化時代來臨。

2004 年 3 月， 正式 成立 醫師教育小組每季定期進行同理心溝通技巧、醫療倫理、病人安全相關課程，並有問卷分析作為改進之參考。

2004 年 3 月， 主辦台灣教會醫院協會年會，就「建構安全的教會醫院」進行反省與學習。

2004 年 3 月，獲行政院勞委會重視女性人力資源優良事業單位評鑑唯一獲獎醫療院所。

2004 年 3 月，獲衛生署國民健康局委託於阿里山鄉南三村推動全國首創 「安全社區營造」。

2004 年 6 月，電腦會診系統上線，使用手機簡訊 通知 醫師會診，會診資訊不漏接。

2004 年 10 月， 榮獲經濟部節約能源績優廠商優等獎。

2004 年 10 月， 主辦「 CCMM 路加傳道會全國醫務人員退修會」，共同學習以耶穌基督的愛來從事醫療傳道及社會關懷工作。

2004 年 12 月，嘉基社區醫療群榮獲醫策會頒發參予「社區醫療品質提昇先導計劃」最佳合作夥伴。

2004 年 12 月，護理之家榮獲行政院衛生署全國護理之家訪查「優等獎」。

2004 年 12 月，獲衛生署及台灣醫務管理學會聯合認証為「雙語親善醫院」。

2004 年 12 月，網站獲衛生署評選為優良健康資訊網站。

2004 年 12 月， 榮獲行政院衛生署國民健康局「全國菸害防制優良職場」績優執行獎。

2005 年 1 月，南亞海嘯，嘉基救災醫療團前往印尼災區進行醫療救援。

2005 年 1 月，完成第七例腎臟移植手術。

2005 年 3 月，本院在屏東縣大同國小車禍事件中，大量傷患處理能力獲肯定。

2005 年 8 月，實驗診斷科通過中華民國實驗室認證體系 (CNLA) 醫學領域認證。

2005 年 10 月，阿里山安全社區榮獲世界衛生組織（ WHO ）認證。

2005 年 10 月，承辦全國老人日托博覽會。

2005 年 10 月， 接受衛生署及外交部的託付，與菲律賓蘇素銀省立醫院締結姊妹醫院 ，傳遞醫療關懷成為落後地區的醫療顧問團。

2005 年 10 月， 榮獲行政院衛生署及台灣婦產科醫學會共同頒發「母嬰親善醫院認證」。

2005 年 11 月， 積極 投入子宮頸抹片篩檢，獲嘉義市政府表揚「功在婦癌」。

2005 年 11 月，於嘉義市西區成立「經國老人綜合服務中心」。

2005 年 12 月，再耕園榮獲行政院公共工程委員第四屆金擘獎優等獎。

2005 年 12 月， 癌症防治中心獲得 行政院衛生署 國 民 健 康 局審定為 A 級補助。

2005 年 12 月， 獲 衛生署國合處 表揚參與「拓展國際衛生外交，推動國際合作衛生醫療計劃」、「醫療器材援助平台計劃」。

2006 年 2 月， 購置 全數位式乳房攝影及穿刺定位系統 X 光機、 全身扇形光束骨質密度測定儀 ， 全面提升 醫療設備，提供病患優質醫療服務。

2006 年 3 月， 翁瑞亨 醫師榮獲「中華民國第十六屆醫療奉獻獎」， 並再度 獲頒行政院衛生獎章。

2006年9月， 購置正子電腦斷層掃描儀﹝PET/CT﹞，提升醫療設備，提供雲嘉南地區癌症病患優質醫療服務，以達「早期發現、早期治療」之目的。

2006年10月，本院榮獲中華民國第六屆國家公益獎 用心醫療。

2006年11月，嘉義基督教醫院網站榮獲行政院衛生署評選為「九十五年度優良健康資訊網站」。

2006年11月本院獲行政院衛生署「優良無菸職場」表揚。

2006年11月，本院獲得衛生署評定為全國醫療院所減廢績優單位 。

2006年11月，本院西城社區健康營造中心 榮獲行政院衛生署國民健康局「全國績優社區優良單位」表揚。

2006 年 11 月，獲經濟部技術處「經濟部創新服務業界科專銀髮族 U-care 旗艦計劃」補助，成立「嘉義銀髮優質生活服務中心」，提供嘉義地區銀髮族更健康、安全、舒適的生活品質。

2006 年 12 月，通過新制醫院評鑑優等，區域教學醫院乙類評鑑。

2006年12月，購置64切電腦斷層掃描儀﹝64切CT﹞，造福雲嘉南地區心血管疾病高危險群民眾。

2006年12月，本院長期投入海外醫療工作，以醫療援助海外偏遠地區人民的需要，獲衛生署頒發「推動國際合作有功獎」。

2007年1月，皮膚科購置「飛梭雷射時光機」，提昇醫療服務內容。

2007年3月，中醫部榮獲衛生署評鑑，為雲嘉地區唯一「優等」之醫院。

2007年3月，榮獲行政院勞委會「兩性平權友善職場」認證。

2007年4月，小兒科醫師陳博憲榮獲「中華民國第十七屆醫療奉獻獎」。

2007年5月，本院心臟外科完成雲嘉地區首例微創「胸部主動脈瘤支架血管置放手術」。

2007年7月，乳房特別門診成立，提供優質就醫環境、照顧婦女隱私。

2007年8月，再耕園蜻蛉玉工房榮獲勞委會2007年多元就業開發方案，計畫執行單位優等獎。

2007年10月，本院為提升對創傷患者的醫療救護品質，成立創傷小組。

2007年10月，成立「病安品管中心」配合病人安全委員會及醫療品質委員會，執行全院病人安全暨品質管相關計劃、推動、執行、監測。

2007年10月，與菲律賓黎剎醫學中心(Rizal Medical Center)締結姊妹醫院，成為嘉基在菲律賓的第二家姊妹醫院。

2007年10月，嘉基榮獲南區健保局評比為醫療服務品質的優質醫院，分別獲得急診照護、糖尿病照護、人膝關節置換手術整體照護滿意度中的前三名。

2007年11月，啟用第二台新型直線加速器，再創癌症治療新紀元。

2007年11月，本院事業廢棄物與資源減量回收再利用，榮獲全國醫療組第一名。

2007年12月，本院接受嘉義市政府委託經營之長青園綜合服務中心開幕。

2007年12月，本院榮獲環保署頒發「第16屆中華民國企業環境環保獎」。

2007年12月，推動醫院營造英語醫療作業環境計劃─外籍人士訪查活動，榮獲台灣醫務管理學會評為優等醫院。

2007年12月，嘉基東院區擴建工程動土，將興建門診大樓、保健醫療大樓與教育訓練中心，預定於2010年完工。

2007年開刀房購置第4台心臟血管檢查機器(C-Arm)， 具有Subtration(減影功能) 與硬碟，能提供即時的影像把握搶救時機。

為提升病人安全，加護病房自2007年開始採專任主治醫師新制。

2008年1月，嘉基「民雄嘉基」、「嘉佳」、「諸羅山嘉基」三個社區醫療群通過衛生署社區醫療群醫療品質的訪查，獲頒品質優等獎。

2008年4月，嘉基創院五十週年，舉辦「千人鐵馬行─嘉基GO活力」、「登峰造極玉山行」、「風華五十光耀嘉基─懷舊晚會」系列慶祝活動及研討會，創院院長戴德森夫人其家人、外籍宣教醫師護士共21人返台，一同參與院慶活動。

2008年4月，菲律賓蘇素銀省省長來訪，拜會嘉義市政府、嘉基，期望藉由行政文化與醫學交流，相互提升地方建設及醫療品質。

2008年5月，院長陳誠仁等醫護人員兩度深入四川大地震綿陽重災區，協助醫療、心靈重建工作，嘉基並發動院內員工捐款，將愛送到大陸。

2008年7月，獲世界衛生組織(WHO)認證為健康促進醫院。

2008年8月，嘉基志工隊在衛生署舉辦的全國衛生保健績優志工暨團隊「慈心獎」評選中，成為全國醫療組唯一的獲獎志工團隊。

2008年9月，本院獲衛生署選為高溫高壓滅菌鍋成果發表暨觀摩醫院。

2008年9月，本院積極推動傳染病防治工作及院內、院外教育訓練，並協助衛生單位疫病處理及進行醫院院內感染控制業務訪查，且全力配合衛生署疾病管制局進行肺結核於院內暴露研究等防疫業務不遺餘力，在全國「97年度防疫績優獎」中，獲得非公務類防疫績優團體獎。

2008年10月，再耕園接受行政院勞委會「多元就業方案特優單位」表揚。

2008年10月，本院附設護理之家及附設居家護理所榮獲嘉義市衛生局評選為優等。

2008年10月，97年癌症診療品質認證─本院與各醫學中心同獲評為A級。