配備完整的心臟超音波及心導管檢查儀器，更可進行氣球擴張術等治療， 加上與心臟外科的配合，對於先天性心臟病童可提供完善的醫療服務。 民國八十四年起，成為中華民國心臟病兒童基金會合約醫院，並爭取加入全國學童心臟病篩檢計劃， 每年為嘉義地區約八千名學童，免費以電腦心電心音分析儀檢查並治療，對於先天性心臟病的防治不遺餘力。 在兒童過敏免疫科方面