本科各項設備皆為雲嘉地區首屈一指，特別是結石治療、惡性腫瘤之治療、腎臟移植。結石治療方面，本院有「體外震波碎石機」及最高技術「經皮腎碎石取石術」，對於腎臟、輸尿管、膀胱之結石處理，讓病人不需接受手術之苦。

惡性腫瘤治療方面，對於腎臟惡性腫瘤根除手術與膀胱惡性腫瘤根除術，及人造膀胱成型之技術，使病人能與正常人一樣自行解尿，而不須背負尿袋的痛苦。另有『腎臟移植小組』，已有多例移植成功之病例。

此外，本院設有「尿路動態檢查中心」，提供尿流速測試、膀胱測量、尿道壓力測量及骨盆肌電圖等，對於中風後脊髓外傷病患能提供精確的膀胱功能評估，對於前列腺肥大、尿失禁的病患更能提供治療的有效參考資料。

前列腺肥大症、尿道狹窄、腎結石、疝氣、輸尿管結石、膀胱結石、男性精索靜脈曲張、包皮手術、陰囊水腫、婦女尿失禁、血尿、隱睪症、男性不孕、性功能異常、腎腫瘤、膀胱腫瘤

特殊檢查及治療項目：

體外震波碎石術、攝護腺肥大症治療、小兒疝氣（脫腸）、隱睪症治療、尿路結石內視鏡手術治療、男性不孕顯微手術、腫瘤手術、腎臟移植

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