中醫是國人的傳統醫療，迄今仍深受許多國人的信賴，也是病痛時求醫的重要主力，有感於雲嘉地區鄉親的殷切需求，嘉基十年前即成立中醫部門，並逐步發展，迄今已有內、婦、兒、針、傷等五科分科完整的門診醫療服務，甚至因服務量的急速增加，為滿足民眾需求，不僅醫師配合各專科的發展不斷增加，門診也數次搬遷讓空間得以擴展，如今中醫更提供肝膽胃腸、過敏體質、關節痠痛、婦科疾病及更年期、小兒過敏及腸胃、自律神經失調、腦血管疾病等特別門診。
嘉基中醫是一個充滿活力的團隊，除了上述的門診陣容，他們也投身與西醫合作，為住院病患提供更完整的服務，例如參與癌症治療團隊，提供安寧病房及血液腫瘤病房的中醫會診，協助婦產科的產婦作產後中藥調養，另外還創設中醫與放射腫瘤科聯合門診。
在社區服務項目，中醫也沒有缺席，他們很早就開始無中醫鄉山區醫療服務計劃，推動阿里山鄉南三村的山地醫療，配搭家醫科、牙醫，形成南三村山區的完整醫療服務，近年來更定期在嘉義東石聖心教養院，為重度肢障兒童進行中醫醫療服務。
為了提昇品質，中醫積極參與衛生署的各項計劃，例如中醫門診教學計劃，中風、腦性麻痺、氣喘等提昇中醫品質計劃，民國95年10月更率先接受衛生署評鑑，同時被列為全國12優等中醫院所之一，也是雲嘉地區唯一榮獲優等的中醫院所。
百尺竿頭、更進一步，嘉基中醫師群不斷繼續研究進修，有同仁前往中正大學分子生物研究所博士班進修，也有於中國醫藥大學中醫研究所進修，還有與嘉義大學進行合作研究計劃，嘉基中醫的確是生氣蓬勃的一群，願上帝祝福你們，同伴們！